Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tgfb2P27090 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tgfb2P27090 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tgfb2P27090 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tgfb2P27090 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tgfb2P27090 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tgfb2P27090 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tgfb2P27090 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tgfb2P27090 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tgfb2P27090 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tgfb2P27090 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Tgfb2P27090 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tgfb2P27090 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tgfb2P27090 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tgfb2P27090 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tgfb2P27090 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tgfb2P27090 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tgfb2P27090 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Tgfb2P27090 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tgfb2P27090 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tgfb2P27090 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tgfb2P27090 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tgfb2P27090 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tgfb2P27090 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tgfb2P27090 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tgfb2P27090 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tgfb2P27090 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tgfb2P27090 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Tgfb2P27090 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tgfb2P27090 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tgfb2P27090 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tgfb2P27090 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tgfb2P27090 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tgfb2P27090 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tgfb2P27090 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tgfb2P27090 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tgfb2P27090 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tgfb2P27090 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tgfb2P27090 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tgfb2P27090 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tgfb2P27090 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tgfb2P27090 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tgfb2P27090 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tgfb2P27090 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tgfb2P27090 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tgfb2P27090 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tgfb2P27090 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tgfb2P27090 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tgfb2P27090 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tgfb2P27090 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tgfb2P27090 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tgfb2P27090 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tgfb2P27090 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tgfb2P27090 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tgfb2P27090 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tgfb2P27090 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Tgfb2P27090 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tgfb2P27090 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tgfb2P27090 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tgfb2P27090 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tgfb2P27090 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tgfb2P27090 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tgfb2P27090 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tgfb2P27090 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tgfb2P27090 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tgfb2P27090 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tgfb2P27090 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tgfb2P27090 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tgfb2P27090 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Tgfb2P27090 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tgfb2P27090 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tgfb2P27090 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Tgfb2P27090 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Tgfb2P27090 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tgfb2P27090 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tgfb2P27090 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tgfb2P27090 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tgfb2P27090 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tgfb2P27090 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tgfb2P27090 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tgfb2P27090 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tgfb2P27090 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tgfb2P27090 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tgfb2P27090 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Tgfb2P27090 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tgfb2P27090 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Tgfb2P27090 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tgfb2P27090 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tgfb2P27090 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tgfb2P27090 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tgfb2P27090 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tgfb2P27090 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tgfb2P27090 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tgfb2P27090 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tgfb2P27090 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tgfb2P27090 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tgfb2P27090 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tgfb2P27090 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tgfb2P27090 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Tgfb2P27090 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms