Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmo2P25801 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmo2P25801 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmo2P25801 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmo2P25801 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmo2P25801 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmo2P25801 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmo2P25801 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmo2P25801 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmo2P25801 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmo2P25801 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmo2P25801 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmo2P25801 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmo2P25801 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmo2P25801 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmo2P25801 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmo2P25801 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmo2P25801 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmo2P25801 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmo2P25801 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmo2P25801 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmo2P25801 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmo2P25801 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmo2P25801 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmo2P25801 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmo2P25801 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmo2P25801 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmo2P25801 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmo2P25801 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmo2P25801 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmo2P25801 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmo2P25801 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmo2P25801 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmo2P25801 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmo2P25801 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmo2P25801 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmo2P25801 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmo2P25801 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmo2P25801 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmo2P25801 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmo2P25801 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmo2P25801 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmo2P25801 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmo2P25801 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmo2P25801 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmo2P25801 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmo2P25801 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmo2P25801 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmo2P25801 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmo2P25801 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmo2P25801 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmo2P25801 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmo2P25801 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmo2P25801 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmo2P25801 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmo2P25801 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms