Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd247P24161 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd247P24161 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Cd247P24161 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd247P24161 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd247P24161 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd247P24161 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd247P24161 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd247P24161 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cd247P24161 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd247P24161 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd247P24161 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd247P24161 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd247P24161 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd247P24161 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd247P24161 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd247P24161 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd247P24161 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd247P24161 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd247P24161 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd247P24161 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd247P24161 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd247P24161 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd247P24161 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd247P24161 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd247P24161 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cd247P24161 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd247P24161 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd247P24161 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd247P24161 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd247P24161 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd247P24161 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd247P24161 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd247P24161 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd247P24161 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd247P24161 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms