Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tap1P21958 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tap1P21958 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tap1P21958 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tap1P21958 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tap1P21958 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tap1P21958 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tap1P21958 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tap1P21958 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tap1P21958 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tap1P21958 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tap1P21958 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tap1P21958 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tap1P21958 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tap1P21958 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tap1P21958 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tap1P21958 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tap1P21958 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tap1P21958 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tap1P21958 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tap1P21958 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tap1P21958 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tap1P21958 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tap1P21958 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tap1P21958 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tap1P21958 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tap1P21958 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tap1P21958 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tap1P21958 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tap1P21958 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tap1P21958 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tap1P21958 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tap1P21958 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tap1P21958 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tap1P21958 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tap1P21958 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tap1P21958 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tap1P21958 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tap1P21958 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tap1P21958 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tap1P21958 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tap1P21958 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tap1P21958 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tap1P21958 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tap1P21958 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tap1P21958 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tap1P21958 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tap1P21958 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tap1P21958 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tap1P21958 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tap1P21958 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tap1P21958 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tap1P21958 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tap1P21958 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tap1P21958 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tap1P21958 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tap1P21958 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tap1P21958 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tap1P21958 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tap1P21958 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tap1P21958 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tap1P21958 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tap1P21958 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tap1P21958 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tap1P21958 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tap1P21958 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms