Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou3f1P21952 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou3f1P21952 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pou3f1P21952 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou3f1P21952 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou3f1P21952 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou3f1P21952 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou3f1P21952 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou3f1P21952 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou3f1P21952 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou3f1P21952 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou3f1P21952 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms