Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BdnfP21237 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BdnfP21237 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BdnfP21237 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BdnfP21237 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BdnfP21237 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BdnfP21237 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BdnfP21237 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BdnfP21237 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BdnfP21237 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BdnfP21237 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BdnfP21237 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BdnfP21237 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BdnfP21237 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BdnfP21237 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BdnfP21237 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BdnfP21237 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BdnfP21237 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BdnfP21237 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BdnfP21237 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BdnfP21237 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BdnfP21237 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BdnfP21237 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BdnfP21237 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BdnfP21237 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BdnfP21237 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BdnfP21237 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BdnfP21237 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BdnfP21237 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BdnfP21237 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BdnfP21237 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BdnfP21237 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BdnfP21237 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BdnfP21237 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BdnfP21237 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms