Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
PrkcaP20444 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkcaP20444 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms