Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ntf3P20181 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ntf3P20181 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ntf3P20181 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ntf3P20181 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ntf3P20181 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ntf3P20181 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ntf3P20181 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ntf3P20181 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ntf3P20181 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ntf3P20181 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ntf3P20181 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ntf3P20181 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ntf3P20181 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ntf3P20181 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ntf3P20181 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ntf3P20181 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ntf3P20181 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ntf3P20181 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ntf3P20181 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ntf3P20181 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ntf3P20181 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ntf3P20181 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ntf3P20181 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ntf3P20181 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ntf3P20181 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ntf3P20181 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ntf3P20181 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ntf3P20181 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.3 ms