Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ms4a1P19437 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ms4a1P19437 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ms4a1P19437 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ms4a1P19437 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ms4a1P19437 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ms4a1P19437 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ms4a1P19437 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ms4a1P19437 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ms4a1P19437 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ms4a1P19437 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ms4a1P19437 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ms4a1P19437 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ms4a1P19437 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ms4a1P19437 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ms4a1P19437 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ms4a1P19437 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ms4a1P19437 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ms4a1P19437 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ms4a1P19437 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ms4a1P19437 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ms4a1P19437 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ms4a1P19437 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ms4a1P19437 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ms4a1P19437 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ms4a1P19437 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ms4a1P19437 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ms4a1P19437 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ms4a1P19437 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ms4a1P19437 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ms4a1P19437 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ms4a1P19437 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ms4a1P19437 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ms4a1P19437 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ms4a1P19437 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ms4a1P19437 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ms4a1P19437 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ms4a1P19437 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ms4a1P19437 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ms4a1P19437 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ms4a1P19437 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ms4a1P19437 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ms4a1P19437 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ms4a1P19437 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ms4a1P19437 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ms4a1P19437 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ms4a1P19437 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ms4a1P19437 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ms4a1P19437 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ms4a1P19437 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ms4a1P19437 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ms4a1P19437 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ms4a1P19437 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ms4a1P19437 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ms4a1P19437 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ms4a1P19437 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ms4a1P19437 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ms4a1P19437 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ms4a1P19437 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ms4a1P19437 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ms4a1P19437 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ms4a1P19437 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ms4a1P19437 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ms4a1P19437 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms