Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tgfb3P17125 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tgfb3P17125 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tgfb3P17125 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tgfb3P17125 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tgfb3P17125 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tgfb3P17125 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tgfb3P17125 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tgfb3P17125 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tgfb3P17125 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tgfb3P17125 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tgfb3P17125 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tgfb3P17125 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tgfb3P17125 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tgfb3P17125 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tgfb3P17125 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tgfb3P17125 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tgfb3P17125 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tgfb3P17125 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tgfb3P17125 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgfb3P17125 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgfb3P17125 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgfb3P17125 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgfb3P17125 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgfb3P17125 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgfb3P17125 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgfb3P17125 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgfb3P17125 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfb3P17125 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfb3P17125 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfb3P17125 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfb3P17125 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgfb3P17125 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb3P17125 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb3P17125 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb3P17125 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgfb3P17125 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgfb3P17125 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms