Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rag1P15919 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rag1P15919 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rag1P15919 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rag1P15919 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rag1P15919 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rag1P15919 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rag1P15919 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rag1P15919 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rag1P15919 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rag1P15919 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rag1P15919 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rag1P15919 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rag1P15919 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rag1P15919 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rag1P15919 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rag1P15919 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rag1P15919 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rag1P15919 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rag1P15919 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rag1P15919 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rag1P15919 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rag1P15919 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rag1P15919 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rag1P15919 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rag1P15919 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rag1P15919 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rag1P15919 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rag1P15919 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rag1P15919 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rag1P15919 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rag1P15919 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rag1P15919 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rag1P15919 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rag1P15919 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rag1P15919 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rag1P15919 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rag1P15919 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rag1P15919 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rag1P15919 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rag1P15919 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rag1P15919 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rag1P15919 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rag1P15919 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rag1P15919 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rag1P15919 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rag1P15919 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rag1P15919 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rag1P15919 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rag1P15919 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rag1P15919 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rag1P15919 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rag1P15919 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rag1P15919 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rag1P15919 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rag1P15919 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rag1P15919 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rag1P15919 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rag1P15919 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rag1P15919 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rag1P15919 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rag1P15919 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rag1P15919 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rag1P15919 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rag1P15919 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rag1P15919 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rag1P15919 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rag1P15919 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rag1P15919 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rag1P15919 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms