Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd44P15379 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd44P15379 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd44P15379 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd44P15379 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd44P15379 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd44P15379 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd44P15379 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd44P15379 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd44P15379 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd44P15379 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd44P15379 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd44P15379 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd44P15379 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd44P15379 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd44P15379 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd44P15379 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd44P15379 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd44P15379 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd44P15379 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd44P15379 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd44P15379 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd44P15379 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd44P15379 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd44P15379 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd44P15379 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd44P15379 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd44P15379 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd44P15379 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd44P15379 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cd44P15379 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cd44P15379 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd44P15379 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd44P15379 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd44P15379 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cd44P15379 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cd44P15379 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cd44P15379 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd44P15379 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd44P15379 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd44P15379 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms