Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Dnmt1P13864 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Dnmt1P13864 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Dnmt1P13864 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Dnmt1P13864 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Dnmt1P13864 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Dnmt1P13864 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Dnmt1P13864 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Dnmt1P13864 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Dnmt1P13864 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Dnmt1P13864 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Dnmt1P13864 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Dnmt1P13864 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Dnmt1P13864 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Dnmt1P13864 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Dnmt1P13864 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Dnmt1P13864 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Dnmt1P13864 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Dnmt1P13864 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Dnmt1P13864 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Dnmt1P13864 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Dnmt1P13864 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Dnmt1P13864 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Dnmt1P13864 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Dnmt1P13864 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Dnmt1P13864 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Dnmt1P13864 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Dnmt1P13864 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Dnmt1P13864 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Dnmt1P13864 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Dnmt1P13864 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Dnmt1P13864 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Dnmt1P13864 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Dnmt1P13864 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Dnmt1P13864 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Dnmt1P13864 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Dnmt1P13864 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Dnmt1P13864 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Dnmt1P13864 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Dnmt1P13864 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Dnmt1P13864 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Dnmt1P13864 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Dnmt1P13864 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Dnmt1P13864 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Dnmt1P13864 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Dnmt1P13864 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Dnmt1P13864 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Dnmt1P13864 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Dnmt1P13864 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Dnmt1P13864 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Dnmt1P13864 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Dnmt1P13864 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Dnmt1P13864 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Dnmt1P13864 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Dnmt1P13864 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Dnmt1P13864 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Dnmt1P13864 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Dnmt1P13864 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Dnmt1P13864 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Dnmt1P13864 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Dnmt1P13864 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Dnmt1P13864 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Dnmt1P13864 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Dnmt1P13864 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Dnmt1P13864 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Dnmt1P13864 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Dnmt1P13864 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Dnmt1P13864 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Dnmt1P13864 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Dnmt1P13864 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Dnmt1P13864 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Dnmt1P13864 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Dnmt1P13864 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Dnmt1P13864 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Dnmt1P13864 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Dnmt1P13864 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Dnmt1P13864 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Dnmt1P13864 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Dnmt1P13864 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Dnmt1P13864 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Dnmt1P13864 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Dnmt1P13864 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Dnmt1P13864 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Dnmt1P13864 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Dnmt1P13864 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Dnmt1P13864 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Dnmt1P13864 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Dnmt1P13864 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Dnmt1P13864 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Dnmt1P13864 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Dnmt1P13864 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Dnmt1P13864 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Dnmt1P13864 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Dnmt1P13864 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Dnmt1P13864 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Dnmt1P13864 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Dnmt1P13864 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Dnmt1P13864 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Dnmt1P13864 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Dnmt1P13864 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms