Protein–RNA interactions for Protein: P13412

Tnni2, Troponin I, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni2P13412 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Tnni2P13412 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Tnni2P13412 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Tnni2P13412 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Tnni2P13412 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,47■■□□□ 1,83
Tnni2P13412 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Tnni2P13412 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Tnni2P13412 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Tnni2P13412 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Tnni2P13412 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Tnni2P13412 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Tnni2P13412 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26,46■■□□□ 1,83
Tnni2P13412 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Tnni2P13412 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26,44■■□□□ 1,82
Tnni2P13412 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Tnni2P13412 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Tnni2P13412 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Tnni2P13412 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Tnni2P13412 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Tnni2P13412 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Tnni2P13412 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Tnni2P13412 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Tnni2P13412 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Tnni2P13412 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Tnni2P13412 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Tnni2P13412 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Tnni2P13412 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,41■■□□□ 1,82
Tnni2P13412 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Tnni2P13412 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26,4■■□□□ 1,82
Tnni2P13412 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26,4■■□□□ 1,82
Tnni2P13412 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Tnni2P13412 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26,39■■□□□ 1,82
Tnni2P13412 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26,39■■□□□ 1,82
Tnni2P13412 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
Tnni2P13412 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Tnni2P13412 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Tnni2P13412 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Tnni2P13412 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Tnni2P13412 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Tnni2P13412 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Tnni2P13412 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Tnni2P13412 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Tnni2P13412 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Tnni2P13412 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Tnni2P13412 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Tnni2P13412 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Tnni2P13412 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Tnni2P13412 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Tnni2P13412 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Tnni2P13412 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Tnni2P13412 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Tnni2P13412 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Tnni2P13412 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Tnni2P13412 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Tnni2P13412 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Tnni2P13412 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Tnni2P13412 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Tnni2P13412 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Tnni2P13412 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Tnni2P13412 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Tnni2P13412 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Tnni2P13412 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Tnni2P13412 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Tnni2P13412 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Tnni2P13412 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Tnni2P13412 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Tnni2P13412 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Tnni2P13412 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Tnni2P13412 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Tnni2P13412 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Tnni2P13412 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Tnni2P13412 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Tnni2P13412 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Tnni2P13412 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Tnni2P13412 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Tnni2P13412 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26,26■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26,26■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26,24■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Tnni2P13412 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35,7 ms