Protein–RNA interactions for Protein: P12400

Ctla2b, Protein CTLA-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2bP12400 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctla2bP12400 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctla2bP12400 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctla2bP12400 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctla2bP12400 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctla2bP12400 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctla2bP12400 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctla2bP12400 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctla2bP12400 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms