Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DmdP11531 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DmdP11531 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DmdP11531 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DmdP11531 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DmdP11531 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DmdP11531 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DmdP11531 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DmdP11531 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DmdP11531 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DmdP11531 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DmdP11531 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DmdP11531 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DmdP11531 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DmdP11531 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DmdP11531 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DmdP11531 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DmdP11531 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DmdP11531 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DmdP11531 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DmdP11531 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DmdP11531 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DmdP11531 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DmdP11531 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DmdP11531 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DmdP11531 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DmdP11531 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DmdP11531 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DmdP11531 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DmdP11531 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DmdP11531 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DmdP11531 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DmdP11531 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DmdP11531 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DmdP11531 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DmdP11531 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DmdP11531 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DmdP11531 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DmdP11531 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DmdP11531 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DmdP11531 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DmdP11531 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DmdP11531 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DmdP11531 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DmdP11531 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DmdP11531 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DmdP11531 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DmdP11531 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DmdP11531 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DmdP11531 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DmdP11531 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DmdP11531 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DmdP11531 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DmdP11531 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DmdP11531 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DmdP11531 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DmdP11531 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DmdP11531 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DmdP11531 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DmdP11531 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DmdP11531 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DmdP11531 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DmdP11531 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DmdP11531 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DmdP11531 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DmdP11531 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DmdP11531 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DmdP11531 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DmdP11531 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DmdP11531 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DmdP11531 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DmdP11531 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DmdP11531 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DmdP11531 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DmdP11531 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DmdP11531 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DmdP11531 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DmdP11531 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DmdP11531 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DmdP11531 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DmdP11531 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DmdP11531 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DmdP11531 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DmdP11531 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DmdP11531 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DmdP11531 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DmdP11531 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DmdP11531 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DmdP11531 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DmdP11531 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DmdP11531 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DmdP11531 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DmdP11531 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DmdP11531 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DmdP11531 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DmdP11531 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DmdP11531 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DmdP11531 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DmdP11531 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DmdP11531 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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