Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cxcl2P10889 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl2P10889 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl2P10889 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxcl2P10889 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms