Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
P10404 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
P10404 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
P10404 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
P10404 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
P10404 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
P10404 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
P10404 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
P10404 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
P10404 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
P10404 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
P10404 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
P10404 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
P10404 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
P10404 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
P10404 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
P10404 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
P10404 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
P10404 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
P10404 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
P10404 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
P10404 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
P10404 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
P10404 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
P10404 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
P10404 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
P10404 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
P10404 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
P10404 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
P10404 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
P10404 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
P10404 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
P10404 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
P10404 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
P10404 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
P10404 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
P10404 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
P10404 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
P10404 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
P10404 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P10404 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
P10404 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
P10404 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P10404 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P10404 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P10404 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
P10404 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
P10404 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P10404 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P10404 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P10404 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
P10404 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
P10404 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
P10404 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
P10404 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
P10404 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
P10404 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
P10404 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
P10404 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
P10404 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P10404 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P10404 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
P10404 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
P10404 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P10404 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P10404 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P10404 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
P10404 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
P10404 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P10404 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P10404 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
P10404 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P10404 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P10404 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P10404 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P10404 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P10404 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P10404 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P10404 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P10404 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P10404 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P10404 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P10404 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P10404 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P10404 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P10404 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P10404 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P10404 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P10404 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P10404 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P10404 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P10404 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P10404 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P10404 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P10404 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P10404 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P10404 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
P10404 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P10404 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P10404 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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