Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb4P10284 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb4P10284 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb4P10284 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb4P10284 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb4P10284 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb4P10284 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxb4P10284 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb4P10284 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb4P10284 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb4P10284 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxb4P10284 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb4P10284 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb4P10284 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb4P10284 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb4P10284 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb4P10284 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxb4P10284 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxb4P10284 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxb4P10284 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxb4P10284 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxb4P10284 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxb4P10284 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxb4P10284 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxb4P10284 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxb4P10284 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxb4P10284 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxb4P10284 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxb4P10284 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxb4P10284 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxb4P10284 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxb4P10284 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxb4P10284 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxb4P10284 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxb4P10284 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxb4P10284 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxb4P10284 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxb4P10284 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb4P10284 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb4P10284 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb4P10284 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb4P10284 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms