Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ly6c1P0CW02 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ly6c1P0CW02 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6c1P0CW02 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ly6c1P0CW02 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms