Protein–RNA interactions for Protein: P0C0A3

Chmp6, Charged multivesicular body protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp6P0C0A3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp6P0C0A3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp6P0C0A3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp6P0C0A3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp6P0C0A3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp6P0C0A3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp6P0C0A3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp6P0C0A3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp6P0C0A3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Chmp6P0C0A3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp6P0C0A3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp6P0C0A3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp6P0C0A3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp6P0C0A3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp6P0C0A3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp6P0C0A3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp6P0C0A3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp6P0C0A3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp6P0C0A3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp6P0C0A3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp6P0C0A3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp6P0C0A3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chmp6P0C0A3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp6P0C0A3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp6P0C0A3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp6P0C0A3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp6P0C0A3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp6P0C0A3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms