Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ifna9P09235 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifna9P09235 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms