Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax1P09084 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax1P09084 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax1P09084 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax1P09084 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax1P09084 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax1P09084 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax1P09084 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax1P09084 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax1P09084 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax1P09084 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax1P09084 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax1P09084 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax1P09084 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax1P09084 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax1P09084 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax1P09084 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax1P09084 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax1P09084 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax1P09084 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax1P09084 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax1P09084 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax1P09084 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax1P09084 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax1P09084 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax1P09084 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax1P09084 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax1P09084 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax1P09084 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax1P09084 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax1P09084 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax1P09084 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax1P09084 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms