Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itgb1P09055 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb1P09055 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb1P09055 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb1P09055 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb1P09055 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb1P09055 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb1P09055 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb1P09055 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb1P09055 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb1P09055 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb1P09055 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itgb1P09055 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itgb1P09055 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb1P09055 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb1P09055 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb1P09055 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb1P09055 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb1P09055 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb1P09055 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb1P09055 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb1P09055 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb1P09055 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itgb1P09055 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Itgb1P09055 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb1P09055 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms