Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Egr1P08046 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Egr1P08046 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Egr1P08046 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Egr1P08046 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Egr1P08046 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Egr1P08046 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Egr1P08046 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Egr1P08046 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Egr1P08046 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Egr1P08046 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Egr1P08046 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Egr1P08046 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Egr1P08046 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Egr1P08046 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Egr1P08046 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Egr1P08046 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Egr1P08046 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Egr1P08046 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Egr1P08046 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Egr1P08046 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Egr1P08046 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Egr1P08046 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Egr1P08046 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Egr1P08046 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Egr1P08046 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Egr1P08046 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Egr1P08046 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Egr1P08046 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Egr1P08046 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Egr1P08046 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Egr1P08046 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Egr1P08046 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Egr1P08046 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Egr1P08046 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Egr1P08046 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Egr1P08046 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Egr1P08046 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Egr1P08046 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Egr1P08046 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Egr1P08046 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Egr1P08046 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms