Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifna5P07349 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna5P07349 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna5P07349 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms