Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apoa4P06728 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Apoa4P06728 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apoa4P06728 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms