Protein–RNA interactions for Protein: P04235

Cd3d, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3dP04235 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cd3dP04235 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cd3dP04235 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cd3dP04235 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cd3dP04235 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cd3dP04235 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cd3dP04235 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cd3dP04235 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cd3dP04235 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cd3dP04235 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cd3dP04235 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cd3dP04235 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cd3dP04235 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cd3dP04235 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cd3dP04235 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cd3dP04235 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cd3dP04235 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cd3dP04235 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cd3dP04235 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cd3dP04235 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cd3dP04235 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cd3dP04235 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cd3dP04235 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cd3dP04235 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Cd3dP04235 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cd3dP04235 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cd3dP04235 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cd3dP04235 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cd3dP04235 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cd3dP04235 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cd3dP04235 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cd3dP04235 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cd3dP04235 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cd3dP04235 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cd3dP04235 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cd3dP04235 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cd3dP04235 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cd3dP04235 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cd3dP04235 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cd3dP04235 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cd3dP04235 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cd3dP04235 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cd3dP04235 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cd3dP04235 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cd3dP04235 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cd3dP04235 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cd3dP04235 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cd3dP04235 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cd3dP04235 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cd3dP04235 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cd3dP04235 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cd3dP04235 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cd3dP04235 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cd3dP04235 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cd3dP04235 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cd3dP04235 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cd3dP04235 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cd3dP04235 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cd3dP04235 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cd3dP04235 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cd3dP04235 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Cd3dP04235 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cd3dP04235 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cd3dP04235 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cd3dP04235 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cd3dP04235 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cd3dP04235 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cd3dP04235 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cd3dP04235 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cd3dP04235 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cd3dP04235 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms