Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GzmbP04187 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GzmbP04187 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GzmbP04187 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GzmbP04187 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GzmbP04187 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GzmbP04187 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GzmbP04187 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GzmbP04187 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GzmbP04187 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GzmbP04187 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GzmbP04187 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GzmbP04187 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GzmbP04187 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GzmbP04187 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GzmbP04187 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GzmbP04187 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GzmbP04187 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GzmbP04187 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GzmbP04187 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GzmbP04187 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GzmbP04187 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GzmbP04187 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GzmbP04187 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GzmbP04187 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GzmbP04187 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GzmbP04187 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GzmbP04187 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GzmbP04187 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GzmbP04187 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GzmbP04187 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GzmbP04187 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GzmbP04187 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GzmbP04187 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GzmbP04187 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GzmbP04187 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GzmbP04187 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GzmbP04187 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms