Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tk1P04184 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tk1P04184 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tk1P04184 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tk1P04184 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tk1P04184 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tk1P04184 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tk1P04184 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tk1P04184 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tk1P04184 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tk1P04184 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tk1P04184 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tk1P04184 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tk1P04184 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tk1P04184 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tk1P04184 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tk1P04184 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tk1P04184 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tk1P04184 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tk1P04184 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tk1P04184 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tk1P04184 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tk1P04184 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tk1P04184 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tk1P04184 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tk1P04184 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tk1P04184 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tk1P04184 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tk1P04184 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tk1P04184 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tk1P04184 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tk1P04184 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tk1P04184 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tk1P04184 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tk1P04184 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tk1P04184 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tk1P04184 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tk1P04184 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tk1P04184 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tk1P04184 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tk1P04184 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tk1P04184 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tk1P04184 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tk1P04184 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tk1P04184 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tk1P04184 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tk1P04184 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tk1P04184 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tk1P04184 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tk1P04184 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tk1P04184 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tk1P04184 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tk1P04184 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tk1P04184 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tk1P04184 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tk1P04184 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tk1P04184 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tk1P04184 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tk1P04184 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tk1P04184 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tk1P04184 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tk1P04184 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tk1P04184 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tk1P04184 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tk1P04184 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tk1P04184 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms