Protein–RNA interactions for Protein: P03985

T-cell receptor gamma chain C region C7.5, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P03985 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P03985 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P03985 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P03985 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P03985 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P03985 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P03985 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P03985 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03985 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03985 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03985 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03985 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03985 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03985 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03985 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03985 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03985 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03985 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03985 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03985 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03985 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P03985 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P03985 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P03985 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P03985 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P03985 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03985 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03985 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P03985 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03985 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03985 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03985 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03985 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03985 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03985 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03985 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03985 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P03985 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P03985 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P03985 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P03985 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P03985 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P03985 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P03985 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P03985 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P03985 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P03985 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P03985 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P03985 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P03985 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P03985 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P03985 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P03985 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P03985 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P03985 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P03985 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P03985 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P03985 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P03985 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P03985 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P03985 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P03985 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P03985 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P03985 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P03985 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P03985 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P03985 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P03985 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P03985 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P03985 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P03985 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P03985 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P03985 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P03985 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P03985 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P03985 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P03985 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P03985 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P03985 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P03985 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P03985 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P03985 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P03985 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03985 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P03985 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P03985 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03985 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03985 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03985 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P03985 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03985 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03985 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03985 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03985 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03985 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03985 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P03985 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P03985 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P03985 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P03985 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms