Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hoxa7P02830 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hoxa7P02830 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hoxa7P02830 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxa7P02830 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxa7P02830 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hoxa7P02830 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxa7P02830 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxa7P02830 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxa7P02830 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxa7P02830 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hoxa7P02830 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hoxa7P02830 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hoxa7P02830 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hoxa7P02830 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hoxa7P02830 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hoxa7P02830 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxa7P02830 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
Hoxa7P02830 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hoxa7P02830 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Hoxa7P02830 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hoxa7P02830 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxa7P02830 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxa7P02830 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxa7P02830 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxa7P02830 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxa7P02830 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxa7P02830 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxa7P02830 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxa7P02830 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxa7P02830 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxa7P02830 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxa7P02830 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxa7P02830 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxa7P02830 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxa7P02830 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxa7P02830 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxa7P02830 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hoxa7P02830 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hoxa7P02830 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hoxa7P02830 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hoxa7P02830 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxa7P02830 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxa7P02830 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxa7P02830 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxa7P02830 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxa7P02830 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxa7P02830 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxa7P02830 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxa7P02830 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxa7P02830 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxa7P02830 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxa7P02830 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxa7P02830 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxa7P02830 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxa7P02830 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxa7P02830 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hoxa7P02830 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hoxa7P02830 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hoxa7P02830 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hoxa7P02830 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hoxa7P02830 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxa7P02830 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxa7P02830 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxa7P02830 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxa7P02830 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxa7P02830 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxa7P02830 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hoxa7P02830 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Hoxa7P02830 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hoxa7P02830 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms