Protein–RNA interactions for Protein: P01729

Ig lambda-2 chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01729 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01729 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01729 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01729 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01729 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01729 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01729 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01729 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01729 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01729 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01729 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01729 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01729 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01729 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01729 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01729 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01729 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01729 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01729 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01729 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01729 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01729 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01729 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01729 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01729 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01729 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01729 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01729 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01729 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01729 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01729 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01729 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01729 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01729 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01729 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01729 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01729 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01729 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01729 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01729 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01729 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01729 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01729 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01729 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01729 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01729 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01729 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01729 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01729 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01729 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01729 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01729 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01729 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01729 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01729 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01729 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01729 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01729 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01729 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01729 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01729 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01729 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01729 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01729 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01729 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01729 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01729 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01729 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01729 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01729 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01729 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01729 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01729 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01729 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01729 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01729 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01729 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01729 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01729 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01729 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01729 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01729 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01729 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01729 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01729 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01729 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01729 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01729 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01729 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01729 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01729 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01729 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01729 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01729 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01729 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01729 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01729 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01729 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01729 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01729 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms