Protein–RNA interactions for Protein: P01650

Ig kappa chain V-V region UPC 61, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01650 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
P01650 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01650 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01650 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01650 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01650 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01650 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01650 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01650 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01650 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
P01650 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01650 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01650 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01650 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01650 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01650 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
P01650 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01650 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01650 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01650 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01650 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01650 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01650 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01650 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01650 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01650 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01650 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01650 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01650 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01650 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01650 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01650 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01650 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01650 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01650 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01650 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01650 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01650 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
P01650 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
P01650 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01650 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01650 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01650 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01650 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01650 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01650 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01650 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01650 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01650 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01650 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01650 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01650 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01650 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01650 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01650 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01650 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01650 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01650 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01650 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01650 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01650 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01650 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01650 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01650 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01650 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01650 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01650 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01650 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01650 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01650 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01650 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01650 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
P01650 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01650 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01650 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01650 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01650 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01650 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01650 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01650 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
P01650 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01650 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01650 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01650 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01650 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01650 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01650 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01650 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01650 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01650 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01650 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01650 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01650 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01650 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01650 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01650 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
P01650 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
P01650 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
P01650 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01650 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms