Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp8O89110 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp8O89110 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp8O89110 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp8O89110 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp8O89110 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp8O89110 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp8O89110 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp8O89110 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp8O89110 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp8O89110 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp8O89110 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp8O89110 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp8O89110 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp8O89110 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp8O89110 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp8O89110 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp8O89110 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp8O89110 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp8O89110 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp8O89110 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp8O89110 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp8O89110 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp8O89110 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp8O89110 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp8O89110 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp8O89110 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp8O89110 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp8O89110 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp8O89110 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp8O89110 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Casp8O89110 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp8O89110 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp8O89110 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp8O89110 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp8O89110 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp8O89110 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp8O89110 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp8O89110 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp8O89110 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp8O89110 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp8O89110 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp8O89110 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134 ms