Protein–RNA interactions for Protein: O89032

Sh3pxd2a, SH3 and PX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2aO89032 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3pxd2aO89032 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3pxd2aO89032 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3pxd2aO89032 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3pxd2aO89032 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3pxd2aO89032 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3pxd2aO89032 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3pxd2aO89032 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3pxd2aO89032 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3pxd2aO89032 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3pxd2aO89032 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3pxd2aO89032 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3pxd2aO89032 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3pxd2aO89032 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3pxd2aO89032 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3pxd2aO89032 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3pxd2aO89032 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3pxd2aO89032 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3pxd2aO89032 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3pxd2aO89032 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3pxd2aO89032 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3pxd2aO89032 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3pxd2aO89032 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3pxd2aO89032 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3pxd2aO89032 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3pxd2aO89032 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3pxd2aO89032 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3pxd2aO89032 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3pxd2aO89032 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3pxd2aO89032 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3pxd2aO89032 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3pxd2aO89032 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3pxd2aO89032 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3pxd2aO89032 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3pxd2aO89032 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3pxd2aO89032 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3pxd2aO89032 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3pxd2aO89032 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3pxd2aO89032 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3pxd2aO89032 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3pxd2aO89032 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3pxd2aO89032 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3pxd2aO89032 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3pxd2aO89032 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3pxd2aO89032 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3pxd2aO89032 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3pxd2aO89032 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3pxd2aO89032 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3pxd2aO89032 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3pxd2aO89032 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3pxd2aO89032 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3pxd2aO89032 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3pxd2aO89032 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3pxd2aO89032 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3pxd2aO89032 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3pxd2aO89032 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3pxd2aO89032 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3pxd2aO89032 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3pxd2aO89032 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3pxd2aO89032 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3pxd2aO89032 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms