Protein–RNA interactions for Protein: O88888

Apba3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba3O88888 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apba3O88888 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apba3O88888 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apba3O88888 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apba3O88888 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apba3O88888 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apba3O88888 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apba3O88888 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apba3O88888 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apba3O88888 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apba3O88888 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apba3O88888 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apba3O88888 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apba3O88888 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Apba3O88888 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apba3O88888 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apba3O88888 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apba3O88888 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apba3O88888 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apba3O88888 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apba3O88888 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Apba3O88888 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apba3O88888 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apba3O88888 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apba3O88888 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apba3O88888 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apba3O88888 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apba3O88888 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apba3O88888 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apba3O88888 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apba3O88888 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Apba3O88888 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Apba3O88888 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apba3O88888 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apba3O88888 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apba3O88888 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apba3O88888 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apba3O88888 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apba3O88888 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apba3O88888 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apba3O88888 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apba3O88888 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apba3O88888 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Apba3O88888 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apba3O88888 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apba3O88888 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apba3O88888 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apba3O88888 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apba3O88888 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apba3O88888 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apba3O88888 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apba3O88888 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apba3O88888 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apba3O88888 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apba3O88888 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apba3O88888 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apba3O88888 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apba3O88888 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apba3O88888 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apba3O88888 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apba3O88888 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apba3O88888 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Apba3O88888 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apba3O88888 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apba3O88888 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apba3O88888 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apba3O88888 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apba3O88888 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apba3O88888 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apba3O88888 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apba3O88888 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apba3O88888 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apba3O88888 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apba3O88888 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apba3O88888 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apba3O88888 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apba3O88888 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apba3O88888 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apba3O88888 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apba3O88888 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apba3O88888 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apba3O88888 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apba3O88888 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apba3O88888 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apba3O88888 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apba3O88888 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apba3O88888 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apba3O88888 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apba3O88888 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apba3O88888 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apba3O88888 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apba3O88888 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms