Protein–RNA interactions for Protein: O88809

Dcx, Neuronal migration protein doublecortin, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcxO88809 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DcxO88809 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DcxO88809 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DcxO88809 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DcxO88809 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DcxO88809 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DcxO88809 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DcxO88809 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DcxO88809 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DcxO88809 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DcxO88809 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DcxO88809 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DcxO88809 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DcxO88809 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DcxO88809 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DcxO88809 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DcxO88809 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DcxO88809 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DcxO88809 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DcxO88809 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DcxO88809 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DcxO88809 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DcxO88809 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DcxO88809 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DcxO88809 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DcxO88809 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DcxO88809 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DcxO88809 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DcxO88809 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DcxO88809 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DcxO88809 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DcxO88809 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DcxO88809 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DcxO88809 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DcxO88809 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DcxO88809 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DcxO88809 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DcxO88809 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DcxO88809 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DcxO88809 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DcxO88809 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DcxO88809 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DcxO88809 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DcxO88809 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DcxO88809 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DcxO88809 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DcxO88809 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DcxO88809 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DcxO88809 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DcxO88809 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DcxO88809 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DcxO88809 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DcxO88809 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DcxO88809 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DcxO88809 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DcxO88809 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DcxO88809 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DcxO88809 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DcxO88809 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DcxO88809 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DcxO88809 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DcxO88809 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DcxO88809 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DcxO88809 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DcxO88809 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DcxO88809 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DcxO88809 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DcxO88809 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DcxO88809 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DcxO88809 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DcxO88809 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DcxO88809 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DcxO88809 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DcxO88809 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DcxO88809 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DcxO88809 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DcxO88809 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DcxO88809 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DcxO88809 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DcxO88809 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DcxO88809 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DcxO88809 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DcxO88809 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DcxO88809 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DcxO88809 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DcxO88809 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DcxO88809 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DcxO88809 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DcxO88809 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DcxO88809 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DcxO88809 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DcxO88809 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DcxO88809 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DcxO88809 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DcxO88809 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DcxO88809 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DcxO88809 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DcxO88809 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DcxO88809 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DcxO88809 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms