Protein–RNA interactions for Protein: O88532

Zfr, Zinc finger RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfrO88532 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZfrO88532 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZfrO88532 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZfrO88532 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZfrO88532 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZfrO88532 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZfrO88532 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZfrO88532 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms