Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnmt3bO88509 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnmt3bO88509 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnmt3bO88509 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnmt3bO88509 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms