Protein–RNA interactions for Protein: O88466

Znf106, Zinc finger protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 1,888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf106O88466 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf106O88466 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf106O88466 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf106O88466 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf106O88466 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf106O88466 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf106O88466 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf106O88466 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf106O88466 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf106O88466 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf106O88466 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf106O88466 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf106O88466 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf106O88466 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf106O88466 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf106O88466 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf106O88466 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf106O88466 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf106O88466 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf106O88466 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf106O88466 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf106O88466 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf106O88466 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf106O88466 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf106O88466 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf106O88466 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf106O88466 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf106O88466 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf106O88466 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf106O88466 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf106O88466 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf106O88466 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf106O88466 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf106O88466 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf106O88466 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf106O88466 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf106O88466 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf106O88466 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf106O88466 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf106O88466 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf106O88466 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf106O88466 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf106O88466 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf106O88466 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf106O88466 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf106O88466 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf106O88466 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf106O88466 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf106O88466 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf106O88466 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf106O88466 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf106O88466 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf106O88466 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf106O88466 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf106O88466 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf106O88466 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf106O88466 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf106O88466 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf106O88466 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf106O88466 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf106O88466 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf106O88466 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf106O88466 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf106O88466 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf106O88466 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf106O88466 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf106O88466 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf106O88466 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf106O88466 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf106O88466 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf106O88466 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf106O88466 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf106O88466 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms