Protein–RNA interactions for Protein: O70546

Kdm6a, Lysine-specific demethylase 6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6aO70546 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm6aO70546 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm6aO70546 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm6aO70546 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm6aO70546 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm6aO70546 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm6aO70546 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm6aO70546 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm6aO70546 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm6aO70546 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm6aO70546 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm6aO70546 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm6aO70546 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm6aO70546 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm6aO70546 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm6aO70546 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm6aO70546 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm6aO70546 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm6aO70546 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm6aO70546 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm6aO70546 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm6aO70546 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm6aO70546 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm6aO70546 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm6aO70546 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm6aO70546 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm6aO70546 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm6aO70546 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm6aO70546 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm6aO70546 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm6aO70546 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm6aO70546 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm6aO70546 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm6aO70546 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm6aO70546 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm6aO70546 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm6aO70546 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm6aO70546 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm6aO70546 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm6aO70546 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm6aO70546 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm6aO70546 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm6aO70546 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm6aO70546 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm6aO70546 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm6aO70546 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm6aO70546 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm6aO70546 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm6aO70546 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm6aO70546 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm6aO70546 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm6aO70546 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm6aO70546 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm6aO70546 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm6aO70546 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm6aO70546 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm6aO70546 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm6aO70546 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm6aO70546 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm6aO70546 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm6aO70546 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm6aO70546 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm6aO70546 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm6aO70546 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Kdm6aO70546 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kdm6aO70546 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Kdm6aO70546 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Kdm6aO70546 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Kdm6aO70546 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm6aO70546 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm6aO70546 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm6aO70546 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm6aO70546 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm6aO70546 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm6aO70546 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm6aO70546 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm6aO70546 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm6aO70546 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm6aO70546 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm6aO70546 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm6aO70546 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm6aO70546 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm6aO70546 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm6aO70546 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Kdm6aO70546 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Kdm6aO70546 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm6aO70546 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm6aO70546 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm6aO70546 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm6aO70546 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm6aO70546 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm6aO70546 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm6aO70546 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm6aO70546 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm6aO70546 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm6aO70546 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm6aO70546 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm6aO70546 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm6aO70546 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm6aO70546 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.5 ms