Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CtssO70370 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtssO70370 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtssO70370 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtssO70370 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtssO70370 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtssO70370 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CtssO70370 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtssO70370 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtssO70370 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtssO70370 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtssO70370 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtssO70370 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtssO70370 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtssO70370 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtssO70370 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtssO70370 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtssO70370 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtssO70370 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtssO70370 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtssO70370 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtssO70370 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtssO70370 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtssO70370 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtssO70370 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtssO70370 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtssO70370 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtssO70370 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtssO70370 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtssO70370 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtssO70370 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtssO70370 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtssO70370 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtssO70370 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtssO70370 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtssO70370 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtssO70370 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtssO70370 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtssO70370 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtssO70370 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtssO70370 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtssO70370 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtssO70370 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtssO70370 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtssO70370 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtssO70370 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtssO70370 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtssO70370 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtssO70370 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtssO70370 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtssO70370 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtssO70370 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtssO70370 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtssO70370 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtssO70370 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtssO70370 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtssO70370 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtssO70370 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtssO70370 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtssO70370 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtssO70370 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtssO70370 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtssO70370 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtssO70370 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CtssO70370 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CtssO70370 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CtssO70370 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtssO70370 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtssO70370 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtssO70370 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtssO70370 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtssO70370 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtssO70370 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtssO70370 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtssO70370 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CtssO70370 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtssO70370 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtssO70370 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtssO70370 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtssO70370 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtssO70370 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CtssO70370 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtssO70370 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtssO70370 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtssO70370 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtssO70370 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtssO70370 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CtssO70370 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CtssO70370 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CtssO70370 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtssO70370 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtssO70370 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtssO70370 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtssO70370 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CtssO70370 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtssO70370 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtssO70370 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtssO70370 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtssO70370 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtssO70370 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms