Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp2a2O55143 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2a2O55143 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2a2O55143 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2a2O55143 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms