Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mmp10O55123 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mmp10O55123 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mmp10O55123 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mmp10O55123 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mmp10O55123 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mmp10O55123 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mmp10O55123 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mmp10O55123 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Mmp10O55123 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mmp10O55123 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mmp10O55123 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mmp10O55123 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mmp10O55123 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mmp10O55123 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mmp10O55123 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mmp10O55123 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mmp10O55123 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mmp10O55123 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mmp10O55123 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mmp10O55123 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mmp10O55123 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mmp10O55123 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mmp10O55123 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mmp10O55123 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mmp10O55123 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mmp10O55123 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mmp10O55123 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mmp10O55123 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mmp10O55123 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mmp10O55123 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mmp10O55123 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mmp10O55123 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Mmp10O55123 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Mmp10O55123 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Mmp10O55123 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mmp10O55123 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mmp10O55123 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mmp10O55123 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mmp10O55123 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mmp10O55123 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mmp10O55123 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mmp10O55123 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mmp10O55123 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mmp10O55123 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mmp10O55123 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mmp10O55123 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mmp10O55123 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mmp10O55123 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mmp10O55123 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mmp10O55123 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mmp10O55123 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mmp10O55123 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Mmp10O55123 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mmp10O55123 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mmp10O55123 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mmp10O55123 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mmp10O55123 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Mmp10O55123 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mmp10O55123 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mmp10O55123 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mmp10O55123 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mmp10O55123 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Mmp10O55123 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mmp10O55123 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Mmp10O55123 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mmp10O55123 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mmp10O55123 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mmp10O55123 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mmp10O55123 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mmp10O55123 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mmp10O55123 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mmp10O55123 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mmp10O55123 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mmp10O55123 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mmp10O55123 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Mmp10O55123 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mmp10O55123 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mmp10O55123 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mmp10O55123 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mmp10O55123 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mmp10O55123 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mmp10O55123 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mmp10O55123 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mmp10O55123 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mmp10O55123 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mmp10O55123 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mmp10O55123 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mmp10O55123 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mmp10O55123 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mmp10O55123 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mmp10O55123 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mmp10O55123 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mmp10O55123 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Mmp10O55123 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mmp10O55123 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mmp10O55123 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mmp10O55123 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mmp10O55123 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Mmp10O55123 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms