Protein–RNA interactions for Protein: O55106

Strn, Striatin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrnO55106 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
StrnO55106 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
StrnO55106 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
StrnO55106 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
StrnO55106 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
StrnO55106 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
StrnO55106 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
StrnO55106 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
StrnO55106 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
StrnO55106 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
StrnO55106 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
StrnO55106 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
StrnO55106 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
StrnO55106 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
StrnO55106 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
StrnO55106 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
StrnO55106 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
StrnO55106 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
StrnO55106 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
StrnO55106 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
StrnO55106 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
StrnO55106 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
StrnO55106 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
StrnO55106 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
StrnO55106 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
StrnO55106 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
StrnO55106 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
StrnO55106 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
StrnO55106 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
StrnO55106 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
StrnO55106 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
StrnO55106 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
StrnO55106 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
StrnO55106 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
StrnO55106 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
StrnO55106 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
StrnO55106 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
StrnO55106 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
StrnO55106 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
StrnO55106 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
StrnO55106 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
StrnO55106 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
StrnO55106 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
StrnO55106 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
StrnO55106 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
StrnO55106 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
StrnO55106 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
StrnO55106 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
StrnO55106 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
StrnO55106 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
StrnO55106 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
StrnO55106 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
StrnO55106 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
StrnO55106 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
StrnO55106 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
StrnO55106 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
StrnO55106 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
StrnO55106 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
StrnO55106 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
StrnO55106 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
StrnO55106 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
StrnO55106 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
StrnO55106 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
StrnO55106 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
StrnO55106 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
StrnO55106 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
StrnO55106 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
StrnO55106 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
StrnO55106 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
StrnO55106 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
StrnO55106 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
StrnO55106 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
StrnO55106 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
StrnO55106 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
StrnO55106 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
StrnO55106 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
StrnO55106 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
StrnO55106 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
StrnO55106 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
StrnO55106 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
StrnO55106 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
StrnO55106 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
StrnO55106 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
StrnO55106 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
StrnO55106 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
StrnO55106 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
StrnO55106 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
StrnO55106 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
StrnO55106 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
StrnO55106 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
StrnO55106 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
StrnO55106 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
StrnO55106 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
StrnO55106 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
StrnO55106 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
StrnO55106 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
StrnO55106 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
StrnO55106 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
StrnO55106 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
StrnO55106 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 459.1 ms