Protein–RNA interactions for Protein: O55070

Dnase1l3, Deoxyribonuclease gamma, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnase1l3O55070 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnase1l3O55070 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnase1l3O55070 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnase1l3O55070 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnase1l3O55070 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnase1l3O55070 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnase1l3O55070 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnase1l3O55070 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnase1l3O55070 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnase1l3O55070 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnase1l3O55070 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnase1l3O55070 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnase1l3O55070 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnase1l3O55070 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnase1l3O55070 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnase1l3O55070 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnase1l3O55070 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnase1l3O55070 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnase1l3O55070 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnase1l3O55070 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnase1l3O55070 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dnase1l3O55070 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dnase1l3O55070 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnase1l3O55070 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dnase1l3O55070 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dnase1l3O55070 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnase1l3O55070 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnase1l3O55070 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnase1l3O55070 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms