Protein–RNA interactions for Protein: O54990

Prom1, Prominin-1, mousemouse

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom1O54990 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prom1O54990 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Prom1O54990 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Prom1O54990 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Prom1O54990 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prom1O54990 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Prom1O54990 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prom1O54990 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prom1O54990 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prom1O54990 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prom1O54990 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prom1O54990 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prom1O54990 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prom1O54990 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prom1O54990 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prom1O54990 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prom1O54990 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prom1O54990 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prom1O54990 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prom1O54990 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prom1O54990 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prom1O54990 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prom1O54990 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prom1O54990 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prom1O54990 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prom1O54990 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prom1O54990 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prom1O54990 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prom1O54990 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prom1O54990 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prom1O54990 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prom1O54990 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prom1O54990 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prom1O54990 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prom1O54990 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prom1O54990 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prom1O54990 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prom1O54990 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prom1O54990 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prom1O54990 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prom1O54990 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prom1O54990 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prom1O54990 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prom1O54990 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prom1O54990 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prom1O54990 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prom1O54990 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prom1O54990 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prom1O54990 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prom1O54990 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prom1O54990 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prom1O54990 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prom1O54990 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms