Protein–RNA interactions for Protein: O54962

Banf1, Barrier-to-autointegration factor, mousemouse

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Banf1O54962 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Banf1O54962 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Banf1O54962 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Banf1O54962 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Banf1O54962 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Banf1O54962 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Banf1O54962 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Banf1O54962 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Banf1O54962 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Banf1O54962 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Banf1O54962 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Banf1O54962 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Banf1O54962 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Banf1O54962 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Banf1O54962 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Banf1O54962 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Banf1O54962 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Banf1O54962 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Banf1O54962 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Banf1O54962 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Banf1O54962 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Banf1O54962 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Banf1O54962 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Banf1O54962 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms