Protein–RNA interactions for Protein: O35973

Per1, Period circadian protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per1O35973 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Per1O35973 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Per1O35973 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Per1O35973 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Per1O35973 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Per1O35973 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Per1O35973 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Per1O35973 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Per1O35973 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Per1O35973 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Per1O35973 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Per1O35973 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Per1O35973 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Per1O35973 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Per1O35973 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Per1O35973 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Per1O35973 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Per1O35973 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Per1O35973 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Per1O35973 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Per1O35973 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Per1O35973 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Per1O35973 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Per1O35973 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Per1O35973 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Per1O35973 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Per1O35973 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Per1O35973 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Per1O35973 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Per1O35973 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Per1O35973 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Per1O35973 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Per1O35973 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Per1O35973 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Per1O35973 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Per1O35973 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Per1O35973 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Per1O35973 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Per1O35973 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Per1O35973 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Per1O35973 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Per1O35973 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Per1O35973 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Per1O35973 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Per1O35973 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Per1O35973 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Per1O35973 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Per1O35973 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Per1O35973 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Per1O35973 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Per1O35973 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Per1O35973 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Per1O35973 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Per1O35973 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Per1O35973 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Per1O35973 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Per1O35973 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Per1O35973 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Per1O35973 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Per1O35973 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Per1O35973 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Per1O35973 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Per1O35973 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Per1O35973 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Per1O35973 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Per1O35973 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Per1O35973 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Per1O35973 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Per1O35973 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Per1O35973 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Per1O35973 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Per1O35973 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Per1O35973 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Per1O35973 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Per1O35973 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Per1O35973 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Per1O35973 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Per1O35973 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Per1O35973 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Per1O35973 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Per1O35973 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Per1O35973 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Per1O35973 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Per1O35973 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Per1O35973 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Per1O35973 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Per1O35973 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Per1O35973 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Per1O35973 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Per1O35973 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Per1O35973 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Per1O35973 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Per1O35973 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Per1O35973 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Per1O35973 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Per1O35973 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Per1O35973 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Per1O35973 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Per1O35973 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Per1O35973 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms